Numero Basico de Reproduccion de Epidemias R0 COVID-19 para Bolivia

Juan M. Gutierrez - 30/4/2020

Actualizacion: 14/06/2021

Es justo decir que el perfil de riesgo de la crisis de Covid-19 es particularmente amenazante. Si bien existe un libro de jugadas de politicas economicas para hacer frente a las crisis financieras, no existe tal cosa para una congelacion de la economia real a gran escala. No existe una solucion estandar para los problemas de liquidez de economias reales enteras.- Juan M. Gutierrez - 08/04/2020

Nota: Este articulo es un resumen del reporte completo elaborado en R. Los graficos interactivos (Plotly) estan disponibles en el reporte completo en HTML.

Introduccion

El numero basico de reproduccion (R0) es una metrica epidemiologica utilizada para describir la contagio o la transmisibilidad de los agentes infecciosos. R0 se ve afectado por numerosos factores biologicos, socioconductuales y ambientales que gobiernan la transmision de patogenos y, por lo tanto, generalmente se estima con varios tipos de modelos matematicos complejos, lo que hace que R0 sea facilmente tergiversado, malinterpretado y mal aplicado. R0 no es una constante biologica para un patogeno, una tasa a lo largo del tiempo o una medida de la gravedad de la enfermedad, y R0 no puede modificarse mediante campanas de vacunacion. R0 rara vez se mide directamente, y los valores modelados de R0 dependen de las estructuras y suposiciones del modelo. Algunos valores R0 reportados en la literatura cientifica son probablemente obsoletos. R0 debe estimarse, informarse y aplicarse con gran precaucion porque esta metrica basica esta lejos de ser simple.

¿Cuanto se propagara una enfermedad?

La definicion formal de R0 de una enfermedad es el numero de casos que, en promedio, una persona infectada causara durante su periodo infeccioso.

El termino se usa de dos maneras diferentes.

El numero de reproduccion basico representa el potencial epidemico maximo de un patogeno. Describe lo que sucederia si una persona infecciosa ingresara a una comunidad totalmente susceptible y, por lo tanto, es una estimacion basada en un escenario idealizado.

El numero efectivo de reproduccion depende de la susceptibilidad actual de la poblacion. Es probable que esta medida del potencial de transmision sea inferior al numero de reproduccion basico, en funcion de factores como si algunas de las personas estan vacunadas contra la enfermedad o si algunas personas tienen inmunidad debido a la exposicion previa al patogeno. Por lo tanto, la R0 efectiva cambia con el tiempo y es una estimacion basada en una situacion mas realista dentro de la poblacion.

Ejemplos del numero de reproduccion R0 de enfermedades altamente contagiosas

Enfermedad	R0
Ebola	1.51 a 2.53
Influenza H1N1	1.46 a 1.48
Influenza estacional	2 a 3
Sarampion	12 a 18
MERS	alrededor de 1
Polio	5 a 7
SARS	1 a 2.75
Viruela	5 a 7
Wuhan Coronavirus 2019-nCoV	1.4 a 4.08

Acerca del problema del COVID 19

Antes de que se detectara el primer caso en Bolivia, el gobierno anuncio que se habia formado un Comite Operativo de Emergencia, que incluia a funcionarios de la Organizacion Mundial de la Salud y diferentes ministerios y organizaciones de salud especializadas. Las medidas implementadas con la Organizacion Panamericana de la Salud incluyeron apoyo para la implementacion de procedimientos detallados en una guia para la vigilancia de incidentes respiratorios inusuales. El Ministerio de Salud establecio lineas directas gratuitas en 800-10-1104 y 800-10-1106 para informar a las personas sobre los sintomas y permitirles hacer preguntas sobre el virus.

El 17 de marzo, la presidenta Jeanine Anez anuncio las siguientes medidas, que entraran en vigencia del 19 al 31 de marzo: Cierre de todas las fronteras. El ingreso a Bolivia solo esta permitido para ciudadanos y residentes bolivianos, quienes deben seguir los protocolos estipulados por el Ministerio de Salud y la Organizacion Mundial de la Salud. Todos los vuelos internacionales suspendidos. Transporte terrestre interdepartamental e interprovincial suspendido. Solo se puede transportar mercancia.

Decreto 4196 - El 17 de marzo, el ministro de la presidencia, Yerko Nunez, declaro una emergencia de salud publica y organizo una serie de medidas de cuarentena, que se implementarian en todo el pais hasta el 31 de marzo. El Decreto Supremo 4196 indica: El Ministerio de Trabajo, excepcionalmente, regulara la concesion de licencias especiales para proteger a las personas con enfermedades subyacentes, adultos mayores de sesenta anos o mas, personas embarazadas y personas menores de cinco anos si sus padres o tutores tienen una licencia especial. Desde la medianoche (00:00) del 20 de marzo al 31 de marzo, las fronteras del pais estan cerradas. Desde la medianoche (00:00) del 21 de marzo se suspenden los vuelos internacionales, asi como el transporte de pasajeros por tierra, rio y lago. A partir del 18 de marzo, la jornada laboral para todos los sectores es de 9:00 a 13:00. Los mercados y supermercados estan abiertos de 8:00 a 15:00. El transporte publico y privado debe operar de 5:00 a 18:00. Se prohiben las actividades y reuniones sociales, religiosas y de otro tipo. Los que violen el decreto pueden ser arrestados por ocho horas.

Decreto 4199 - Cuarentena a nivel nacional - Una cuarentena nacional esta vigente desde el 22 de marzo a la medianoche (00:00) durante 14 dias, con el objetivo de frenar la propagacion del virus en el pais, bajo las siguientes ordenes. Los mercados y los centros de suministros continuaran operando todas las mananas hasta el mediodia, para que una persona de cada familia pueda obtener suministros. Las fabricas y el transporte que atienden las necesidades basicas de comestibles continuaran funcionando normalmente. El sistema bancario, las farmacias y los hospitales continuaran atendiendo las necesidades de la poblacion. Las personas pueden salir de sus casas si necesitan atencion medica. El transporte privado y publico esta suspendido. Se otorgaran permisos a los trabajadores de transporte cuyas empresas deben continuar trabajando y a las personas que trabajan en servicios de salud, agua, electricidad y gas, entre otros. Los precios de la electricidad se reducen. Esta prohibido cortar el agua, el gas o internet durante la cuarentena. Se facilitaran los pagos de impuestos y prestamos.

Incidencia del COVID-19 en Bolivia

La incidencia del coronavirus, COVID-19, en Bolivia es menor que en los paises vecinos. La tasa de mortalidad en el Bolivia a 28/04/2020 es de 5.23%, considerando 53 personas fallecidas entre los 1,014 casos confirmados. La tasa de tests positivos es de 17.51%. En algunos paises de nuestro entorno la incidencia del COVID-19 Evoluciona de la siguiente manera.

El siguiente grafico nos muestra la relacion entre los casos confirmados los decesos y aquellos que se recuperaron en un grafico por dia que nos ensena la magnitud de cada uno de los tipos de situacion que se enfrenta la incidencia en Bolivia.

Grafico interactivo: La visualizacion interactiva de la incidencia del COVID-19 en Bolivia esta disponible en el reporte completo.

Evolucion de la pandemia a nivel mundial

Estados Unidos se ha convertido en el primer pais del mundo en superar el millon de contagios. El epicentro latinoamericano esta en Brasil, con 5.017 decesos y mas de 70.000 casos positivos de covid-19. Mientras tanto en Mexico, Lopez Obrador considera que se "ha domado" la pandemia al llegar a los 1.569 fallecidos. El pais tiene ya 16.752 casos de contagio y en Jalisco se esta construyendo un cementerio exclusivamente para victimas de coronavirus.

A continuacion mostramos la Base de datos mundial actualizada por pais ordenado por pais con mayor incidencia.

Base de datos mundial

Tabla interactiva: La base de datos mundial interactiva esta disponible en el reporte completo.

Datos de Bolivia

Tabla interactiva: Los datos detallados de Bolivia estan disponibles en el reporte completo.

Numero reproductivo (R0) Para Bolivia

El numero reproductivo (R0), que es el promedio de casos secundarios de una enfermedad causada por un caso primario, Para Bolivia es superior a uno supone el periodo de incubacion medio (calculado a partir del paquete epidemiologico de R earlyR). Los datos examinados sobre las exposiciones entre 10 casos confirmados estimaron que el periodo de incubacion promedio fue de 5.2 dias (intervalo de confianza del 95% con (IC) de 4.1 a 7.0); el percentil 95 de la distribucion fue de 12.5 dias (IC 95%, 9.2 a 18). La informacion sobre 5 grupos de casos, basada en las fechas de inicio de la enfermedad de 6 pares de casos en estos grupos, para Wuhan estimo que la distribucion del intervalo en serie tenia una media (± DE) de 7,5 ± 3,4 dias (IC del 95%, 5.3 a 19) Entonces, utilizamos para todos los otros paises que no tenemos informacion la media del intervalo en serie y la desviacion estandar de 7.5 y 3.4 respectivamente para comparar el proceso del COVID-19. El numero de reproductores para el virus COVID-19 se entiende entre 2 y 2.5, segun el articulo de LI et al. 2020 (https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316)

Para el casos de Bolivia, asumimos la media del intervalo serial y la desviacion estandar de 14 y 7.5 respectivamente. Dado que no hay informacion concreta sobre el periodo de desarrollo para los pacientes bolivianos utilizamos los terminos en el paper de referencia de Li.

Para el casos de Bolivia, asumimos la media del intervalo serial y la desviacion estandar de 14 y 7.5 respectivamente.

Grafico interactivo: El grafico interactivo del R0 para Bolivia esta disponible en el reporte completo.

Por el resultado para Bolivia que obtuvimos podemos pensar que estamos en las mismas circunstancias de expansion que en Wuhan dado que el COVID-19 tiene un intervalo de 1.4 a 4.08.

Analisis de la incidencia de algunos paises del mundo

COVID-19 en Espana

Numero de reproduccion R0: Espana

Se asume para Espana la media y desviacion estandart de 5.5 y 7.5 respectivamente. Fuente: (https://covid19.isciii.es/)

Grafico interactivo: El grafico interactivo del R0 para Espana esta disponible en el reporte completo.

COVID-19 en Italia

Numero de reproduccion R0: Italia

Se asume para Italia la media entre 2.76 y 3.25 con una desviacion estandart de 1.5. Fuente: (https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-seventh-update-Outbreak-of-coronavirus-disease-COVID-19.pdf)

Grafico interactivo: El grafico interactivo del R0 para Italia esta disponible en el reporte completo.

COVID-19 en Ecuador

Numero de reproduccion R0: Ecuador

Grafico interactivo: El grafico interactivo del R0 para Ecuador esta disponible en el reporte completo.

Casos acumulados por tipo Para Bolivia

Grafico interactivo: El grafico interactivo de casos acumulados para Bolivia esta disponible en el reporte completo.

Comparacion con paises de nuestro entorno desde el 10/03/2020

Comparacion diaria de nuevos casos Bolivia, Peru y Ecuador.

Distribucion de casos por dia: Confirmados y Decesos, Bolivia, Argentina, Ecuador, Chile y Peru.

Graficos interactivos: Los graficos interactivos de comparacion entre paises estan disponibles en el reporte completo.

Evolucion de la pandemia a nivel mundial

En los siguientes graficos podremos observar la evolucion del COVID-19.

La Evolucion en Bolivia

PROYECCION DE LA PANDEMIA COVID-19

Las estimaciones de la OMS encontraron que entre los paises europeos el pico diario de mortalidad de la pandemia se produciria durante la tercera semana de abril, los nuevos pronosticos, publicados hoy por el Instituto de Evaluacion y Metrica de Salud (IHME) encuentran que aproximadamente 151,680 personas moriran durante lo que los investigadores llaman la "primera ola" de la pandemia. En comparacion con USA se espera que esta enfrente a 81,766 muertes, segun las previsiones publicadas el domingo por el IHME. El numero de victimas mortales en muchos paises se ve agravada por la demanda de recursos hospitalarios muy por encima de lo que esta disponible. Por ejemplo, el pico de la demanda en el Reino Unido se espera que 102.794 camas hospitalarias se necesitaran.

En Bolivia se desarrollo de esta manera:

• 29 de abril: 1.110 casos confirmados, 59 muertes
• 28 de abril: 1,053 casos confirmados, 55 muertes
• 21 de abril: 609 casos confirmados, 37 muertes
• 14 de abril: 397 casos confirmados, 28 muertes
• 7 de abril: 210 casos confirmados, 15 muertes
• 31 de marzo: 115 casos confirmados, 7 muertes
• 29 de marzo: primera muerte
• 24 de marzo: 32 casos confirmados
• 17 de marzo: 12 casos confirmados
• 10 de marzo: primeros dos casos confirmados

Bolivia - Proyeccion

Creamos una distribucion de intervalos en serie

Al crear la base de la proyeccion de la pandemia del COVID-19 para Bolivia obtendremos una imagen de la proyeccion igual de irregular como los datos oficiales. Cabe resaltar que nosotros en Todo Econometria no evaluamos si los datos son fidedignos los que entregan desde las autoridades sanitarias bolivianas, pero debemos ser cautelosos al mirar estos resultados que distan del comportamiento de cualquier pais con mayores incidencias. De cualquier manera, la proyeccion que realizamos muestra un ascenso en los contagios de manera alarmante si pensamos en las carencias de cuidados intensivos y respiradores disponibles en Bolivia.

El siguiente cuadro muestra la densidad de la curva de contagio respecto a la poblacion de Bolivia

Unimos la frecuencia de los casos reportados por la autoridad sanitaria boliviana y la proyeccion estimada. Asi tendremos una distribucion por los cuantieles de la poblacion.

Mundo

Graficos interactivos: Los mapas mundiales interactivos de casos confirmados y decesos por pais estan disponibles en el reporte completo.

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Este informe fue elaborado por Juan M. Gutierrez, en base a datos de la Universidad Johns Hopkins.

El reporte completo en HTML contiene todos los graficos interactivos (Plotly) y tablas de datos que no pueden visualizarse en formato blog.